针灸科临床上重视经络辨证与四诊合参，以脑病、妇科杂病、周围神经病变、各型痛证为门诊研究方向，在治疗中风（包括脑梗塞、脑出血等）及中风后遗症、中风后智能改变、忧郁症、各种外伤后引起脑及脊髓病变、遗传性脑病、小儿脑瘫、各型面瘫、突发性耳聋、子宫肌瘤、月经不调、内分泌紊乱、各型腰腿痛、骨关节病及各种软组织损伤均取得了较好的疗效。科室以针灸治疗为主，根据病情配合综合治疗，如药熏、热敷、艾灸、透药等治疗。目前开展中医特色诊疗项目30项。

曙光医院建院之初就设有针灸科，曾拥有杨永璇等一代针灸名师临床应诊，并设有门诊和病房收治病人，是“十二五”国家中医药管理局重点专科 ，国家中医药管理局重点专病（针刺麻醉） ，上海市中医临床优势专科 。目前科室是海派中医流派“杨氏针灸”的传承总基地 、全国名老中医药专家（李鼎）传承工作室临床基地 、上海市杨氏针灸疗法非物质文化遗产保护单位等。科室在医疗上积极继承发扬前辈医家的学术思想，拓展流派优势病种，深入研究特色疗法的机理。形成科室针对面瘫病、中风病、肩凝证等疾病的诊疗方案和临床路径，以及形成了“项八针”防治颈椎病、针刺麻醉等规范化诊治技术。在病房里运用刺络拔罐等传统特色技术，获得病人一致好评。

针灸学教研室以曙光临床医教学处和上海中医药大学工作计划为指导，以课堂和临床教学改革为重点，以提升教育教学质量为中心，以教学管理精细为抓手，承担了上海中医药大学本科生、七年制学生、研究生、住院医师规范化培训基地医师、外国留学生、成人教育等的《针灸学》、《经络腧穴学》、《针灸治疗学》的课堂教学及临床见习、实习带教工作。并以教研室主任负责，安排高年资医师专人临床带教和考评，进行定期学术讲座。培养了近百名硕博士研究生、七年制硕士生，积累了丰富的教学经验，确立了“以人为本，强化基础，注重素质，培养能力”的教育理念，致力于开拓并运用各项国内外先进教育方法，提高教育质量，加强学生的基本理论、基础知识、基本技能训练，提高学生综合运用知识，科学思维及临床实战的能力。自2006年至2015年针灸科获得各级各类成果奖5项。其中上海市改革开放30周年“健康上海”十大成果1项，中国中西医结合学会科学技术奖三等奖1项，上海市中西医结合科学技术一等奖1项，上海医学科技奖三等奖1项，其它1项。每年举办国家级继续教育培训班。

近十年科室共发表论文82篇，均为全国性核心期刊，其中SCI8篇。编撰专著及教材7部，其中主编5部，副主编2部。